牡丹江南收费站因地理位置原因，日均绿通车达50辆左右，面对高强度的绿通查验工作，牡丹江南收费站始终严格落实绿通查验政策，全力做好绿色通道保畅工作。
2023年11月23日和26日查验出两台重型低平板半挂货车，两辆货车的司机师傅，刚开始因第一次运输绿通，对绿通政策并不了解，按照绿通政策这类车不符合绿通减免标准。是不能减免通行费的，由于运输的绿通产品对认定结果并不满意，认为只要是运输绿通产品就应该免费，通过值班工作人员耐心的讲解并出示了国家规定文件和网上的事例后，终于明白自己违反了绿通相关规定。对认定结果表示认可。分别缴纳了2701元和2819元。
牡丹江南收费站把绿通车辆查验工作作为重点工作来抓，做到绿通车规范查验，严把绿通查验关，最大限度避免通行费流失，确保通行费颗粒归仓。2023年至今已查验出不合格绿通车辆400台次，收缴通行费14.36万元。