商协会工作要做好，取决于会长及主要领导团队运作能力以及全体会员全力配合，当然，一个商协会运作成效也体现在主持秘书处日常工作的秘书长身上。秘书长基本职责主要包含以下几个内容：
一、具体执行会长办公会、理事会形成的各项决议和决定；
二、协助会长、副会长召集各类会议并负责具体会务工作；
三、负责商会年度工作的计划起草、组织实施、监督检查及总结；
四、会员的联系、发展、服务和管理工作；
五、商会内部各分会、行业协会和团体会员的协调工作；
六、经授权负责商会的财务管理和专职人员聘用；七、商会内部刊物编辑出版以及商会对外宣传联络工作；
八、与所在地业务主管单位、原籍地统战部、工商联以及两地党政有关部门的联系沟通；
九、完成会长及理事会交办的其他事项。
秘书长主持秘书处的日常工作并正确贯彻落实商会领导层的各项决议及会长办公会议精神。秘书长角色特殊，既当配角，又当主角，不仅参与，更当参谋；同时正确处理好与会长、会员关系，做到主动参谋，决不越权，将商协会领导的作用与商协会组织整体作用有机结合起来以彰显工作成效。
总之，商会秘书长是商协会领导的助手和参谋，既要懂得贯彻配合，又不可越位，工作岗位愈重要愈要审视自我，切记高高在上，必须定位正确。日常工作要想会员所想，关心会员所关心，急会员所急。这就要求秘书长必须以端正的工作态度和独到有效的工作方法，凝聚商协会所有成员智慧与力量，发展好商协会。