1、试验操作产生的偶然误差：TPPA试剂操作相对简单，但个别情况下也可能产生偶然误差，导致异常结果，如U型板孔划花（重复使用的U型板在清洗时用硬质刷，导致内孔划痕较多，阴性样本的致敏粒子不能正常沉淀而看上去像凝集图像）、静置过程中意外震动（导致沉淀粒子散开）等。
2、其他可能导致异常结果的干扰因素：因为样本个体之间的差异，部分患有其他疾病的患者可能会产生与致敏粒子包被的抗原产生非特异性反应的因子，造成异常结果。根据文献中对于异常结果分析，可能会造成异常结果的疾病是：自身免疫性疾病（系统性红斑狼疮、盘状红斑狼疮、药物诱发的红斑狼疮类、风湿性关节炎、混合结缔组织病、自身免疫性溶血性贫血等）、肿瘤（淋巴肉瘤、脑膜瘤、结肠癌）、皮肤病（皮肤相关的螺旋体引起）、生殖器疱疹、麻风、热性病、莱姆病、地方性密螺旋体病（雅司病、品他病）等。以及说明书中提及的服用了含有免疫球蛋白血液制品而呈阳性反应的患者。但以上情况中的人群也并不都出现异常结果，可能还和患者自身的个体差异有关。
3、除疾病外，在孕妇和老年人检测时，也有可能会产生较高概率的异常情况。老年人曾患的基础疾病可能使机体释放诱导产生抗类脂抗体和/或抗T.pallidum抗体（特异性抗体）的交叉抗原，或者个别老年患者体内可能有口腔螺旋体、皮肤相关螺旋体、肠道螺旋体等螺旋体共生，诱导产生抗属、群或特异抗原的交叉反抗体。孕妇在妊娠期间，机体会产生一些特殊物质，可能会导致TPPA检测异常结果（具体何种物质可能会产生影响上不明确）。
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