三尸是先天就伏于父母胞胎中的，并且随着人的降生而与生俱来，《太上三尸中经》：“人之生也，皆寄形于父母胞胎，饱味于五谷精气。是以人之腹中，各有三尸九虫，为人大害。常以庚申之夜上告天帝，以记人之造罪，分毫录奏，欲绝人生籍，减人禄命，令人速死。”
三尸九虫之恶，不仅言人过失，引人出现过失，同时还是人体的糟践者。道教以治三尸为成仙之要，斩得三尸，即证金仙的观念在道教徒心目中根深蒂固。
三尸又叫三尸神或三尸虫，具体包括上尸三虫，中尸三虫，下尸三虫，所以称为“三尸九虫”。三尸虫中之上尸名青姑，中尸名白姑，下尸名血姑，或言上尸称彭踞，中尸称彭踬，下尸称彭矫。九虫则指伏虫、回虫、白虫、肉虫、肺虫、胃虫、鬲虫、赤虫和蜣虫。
1、上尸名彭踞，管人的上焦善恶，上尸住玉枕关。
2、中尸名彭踬，管人的中焦善恶，中尸住夹脊关。
3、下尸名彭矫，管人的下焦善恶，下尸住尾闾关。
三尸住三关，九虫住九窍。三尸九虫，变化多端，阴险莫测，化美色梦遗阳精，化幻景，睡生烦恼。破坏修行者，大道难成，丹道难修。
1、伏虫，住玉枕窍。
2、龙虫，住天柱窍。
3、白虫，住陶道窍。
4、肉虫，住神道窍。
5、赤虫，住夹脊窍。
6、隔虫，住玄枢窍。
7、肺虫，住命门窍。
8、胃虫，住龙虎窍。
9、蜣虫，住尾闾窍。
葛洪指出，“三尸”就是寄生在人体内的害虫。“三”表示这种害虫数目巨大，“尸”则是这些寄生虫的名字。陶弘景则认为“三”是实指，三尸是三种危害最大的寄生虫。
另一方面，三尸除了寄生虫的尸体解释之外，还被认为是人体邪气所化，《云笈七签》卷八十一曰：“其三尸者，托阴气以为灵”，又曰：“(人)死后魂升于天，魄入于地，唯三尸游走，名之曰鬼。”无论灵或鬼，都是道教中极为常见的名词，其本质也就是天地间异于阴阳之气的邪气。
“斩三尸，破九虫”有四种途径和方法解决：
1、守禁忌
上尸好宝物，中尸好五味，下尸好色欲，道教据此要求信徒远离酣食厚味，不要贪图享乐，毫无节制地纵欲。现代人由于过度追求口腹之欲而导致膳食不合理，结果造成营养不良或热量过剩，随之而来的就是肥胖症、高血压、动脉硬化、冠心病或缺铁性贫血、骨质疏松症、维生素缺乏症等各种病症发病率的激增，而嗜烟酗酒、通宵玩乐这些极不健康的生活方式，也在不知不觉中消耗了人身体的元气，与道教清静无为、仙道贵生的思想相违背，无形中也与三尸神对人体的戕害相暗符。
2、药物
《云笈七签》卷八十二中记载了诸多药方，如：“三月三日取桃叶，一云桃根，捣取汁七升，以大醋一升同煎，令得五六分，先食，顿服之。隔宿无食，即尸虫俱下。”
《太虚真人消三尸法》曰：常以春甲寅日、夏丙午日、秋庚申日、冬壬子日，瞑卧时，先捣朱砂、雄黄、雌黄三物，等分细捣，以绵裹之，使如枣大，临卧时塞两耳中，此消三尸炼七魄之道。明日日中时，以东流水沐浴毕，更整饰床席，易着衣物，浣故者，更履屐，先除澡之。
3、符咒
《庚申夜咒尸虫法》：常以庚申夜中平坐，叩齿七下，击额呼彭倨；次叩齿七下，抚心呼彭质；又叩齿七下，扪腰呼彭矫。先两手心书太上咒曰：吾受《太上灵符》《五岳神符》，左手持印，右手持戟，日月入怀，浊气出，清气入。三尸彭倨出，彭质出，彭矫出。急急如律令！
4、导引服气
把两手交叉放在头上，长吸气即吐出。坐在地上，慢慢地伸展两脚，用两手从外边将膝抱起，急低头进入两膝之间，这样两手交叉抱头上行功十三遍，可治三尸病。
叩齿十四次，吞气咽下十四次，为一通，如此做三百通为止。连做二十日，可使体内邪气都消除；做六十日，小病可愈；做一百日，大病可除，藏于体内的三虫和伏尸均可消除，使人精神焕发，面体光泽。
5、守庚申
守庚申是杀三尸最重要的途径，乃是综合了上述四项要素的系统活动。其具体做法：首先是在平时就要“绝粒为宗”，“服气为本”，“斋戒为先”。在庚申之日，先择一静室，安置床榻，并清净心意，斋戒存想，以求得神气的外助内补。静室需“好土香泥，泥饰明密高敞，床褥厚暖，衾枕新洁，不得使杂人秽污，辄到其中”(《内景气诀妙经》)，地须深锄二尺，筛去滓砾，除去秽物，增添好土，捣踏平实，再扬细土，拍踏使之紧实平稳，然后扫洒干净。之后在室内备一香台焚香，每焚一次，则念玄元无上天尊，又念太一真君，呼三一、三元五脏六灵、一身之神，冥心叩齿，静默思之也，通宵达旦。若身体疲倦难忍，也可以伏床小睡数觉，但不能睡熟，“此尸即不得上告天帝”。守庚申时忌讳与异性说笑共处，吃“荤腻、五辛、留滞、冷滑之物”，忌入一切秽恶之处，忌争是非，忌欺罔，此为“太一真君五诫，诚心依之，克获神应”。