气相色谱质谱联用仪GCMS-QP2020基于保留指数的丰富数据库提供多方位应用支持：提供环境保护、食品安全、临床分析的数据库。数据库的保留指数除用于保留时间校正外，还可有效地用于组分鉴定等方面。
在药品残留溶剂分析中经常采用顶空气相色谱法（GC-FID），但该方法定性能力不够。而气相色谱质谱仪（GC-MS）可通过质谱进行定性分析，对目标溶剂附近的峰或目标溶剂之外的未知峰进行识别和判定。使用检测器分流系统可在一次测定中同时得到FID数据和MS数据。
GCMS-QP2020气相色谱-质谱联用仪结合HS-10顶空自动进样器，建立了药品中微量环氧氯丙烷残留的测定方法。在0.01~20.00μg/mL浓度范围内线性关系良好，线性相关系数达到0.9997，检出限在0.025mg/kg。0.05μg/mL标准品溶液连续进样6针，峰面积RSD为2.89%。3个加标浓度下的回收率为87.50%-99.67%。该方法简单方便，能够有效的监测药品中极微量环氧氯丙烷的含量。
GCMS-QP2020气质联用仪，建立了一种食用油中18种多环芳烃的测定方法。采用 WondaSep FL-PR 产品对食用油样品进行净化，同时采用InertCap 35色谱柱进行分离，GCMS-QP2020进行检测。在5~200mg/L浓度范围内各组分线性关系良好，各组分相关系数均达到0.999以上，检出限在0.09~0.49mg/L。100mg/L标准品溶液连续进样5针，峰面积RSD均小于4.16%。50.0 μg/kg加标浓度的加标回收率为73.22%-97.70%。该方法简单方便，能够有效的监测食用油中18种多环芳烃的含量。
单四极杆型气相色谱质谱联用仪GCMS-QP2020可用于测定塑料，适用于邻苯二甲酸二辛酯项目。并且参考多项行业标准RoHS指令2.0版、EN 14372。可应用于电子/半导体行业领域。
RoHS指令的实施，使得许多企业加强了自己产品管控。新版的RoHS指令出台列入了邻苯二甲酸酯的管制。对于邻苯二甲酸酯的检测常见的前处理方法有索式抽提、微波萃取等，并需要对提取液净化，操作烦琐费时，溶剂用量大，不利于企业对其产品的筛查检测。因此，GCMS+Py-Screener系统方法包，即使用热裂解-气相色谱质谱联用仪对树脂、塑料中的邻苯二甲酸二辛酯邻苯二甲酸二辛酯等7种邻苯二甲酸酯含量的进行检测。该方法不需要前处理，直接称取样品上机分析就能得到分析结果。该方法相对于传统方法不需要溶剂提取，可以简单快捷地筛查、检测树脂、塑料样品中邻苯二甲酸二辛酯等7种邻苯二甲酸酯含量，减少了溶剂对环境的污染，有效降低了企业分析成本。